Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops3O88543 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops3O88543 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops3O88543 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops3O88543 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops3O88543 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops3O88543 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops3O88543 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops3O88543 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops3O88543 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops3O88543 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms