Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnmt3bO88509 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnmt3bO88509 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnmt3bO88509 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnmt3bO88509 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnmt3bO88509 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnmt3bO88509 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnmt3bO88509 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnmt3bO88509 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnmt3bO88509 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnmt3bO88509 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnmt3bO88509 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnmt3bO88509 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnmt3bO88509 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dnmt3bO88509 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dnmt3bO88509 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms