Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkcO88445 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkcO88445 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkcO88445 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkcO88445 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkcO88445 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AurkcO88445 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AurkcO88445 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AurkcO88445 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AurkcO88445 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AurkcO88445 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AurkcO88445 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AurkcO88445 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms