Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nid2O88322 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nid2O88322 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nid2O88322 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nid2O88322 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms