Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfdp1O88271 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms