Protein–RNA interactions for Protein: O70546

Kdm6a, Lysine-specific demethylase 6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6aO70546 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm6aO70546 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms