Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vamp4O70480 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms