Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lnx1O70263 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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