Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chrna4O70174 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrna4O70174 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrna4O70174 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrna4O70174 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrna4O70174 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrna4O70174 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrna4O70174 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrna4O70174 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrna4O70174 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrna4O70174 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrna4O70174 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrna4O70174 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrna4O70174 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrna4O70174 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrna4O70174 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrna4O70174 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrna4O70174 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrna4O70174 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrna4O70174 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrna4O70174 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrna4O70174 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrna4O70174 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrna4O70174 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrna4O70174 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrna4O70174 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrna4O70174 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrna4O70174 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrna4O70174 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrna4O70174 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrna4O70174 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrna4O70174 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrna4O70174 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrna4O70174 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrna4O70174 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrna4O70174 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrna4O70174 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrna4O70174 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrna4O70174 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrna4O70174 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms