Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad51dO55230 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rad51dO55230 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rad51dO55230 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad51dO55230 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad51dO55230 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad51dO55230 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad51dO55230 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad51dO55230 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad51dO55230 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad51dO55230 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad51dO55230 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad51dO55230 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad51dO55230 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad51dO55230 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad51dO55230 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad51dO55230 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad51dO55230 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad51dO55230 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad51dO55230 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad51dO55230 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad51dO55230 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad51dO55230 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad51dO55230 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad51dO55230 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad51dO55230 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad51dO55230 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad51dO55230 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad51dO55230 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad51dO55230 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad51dO55230 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad51dO55230 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad51dO55230 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad51dO55230 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad51dO55230 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms