Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChadO55226 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChadO55226 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChadO55226 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChadO55226 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChadO55226 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChadO55226 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChadO55226 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChadO55226 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChadO55226 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChadO55226 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ChadO55226 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChadO55226 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChadO55226 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChadO55226 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChadO55226 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChadO55226 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChadO55226 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChadO55226 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChadO55226 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChadO55226 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChadO55226 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChadO55226 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChadO55226 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChadO55226 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChadO55226 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChadO55226 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChadO55226 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChadO55226 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChadO55226 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChadO55226 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChadO55226 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChadO55226 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChadO55226 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChadO55226 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ChadO55226 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChadO55226 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChadO55226 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChadO55226 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChadO55226 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChadO55226 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChadO55226 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChadO55226 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChadO55226 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChadO55226 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ChadO55226 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ChadO55226 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ChadO55226 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ChadO55226 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ChadO55226 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChadO55226 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChadO55226 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChadO55226 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChadO55226 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ChadO55226 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChadO55226 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChadO55226 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChadO55226 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChadO55226 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChadO55226 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChadO55226 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChadO55226 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChadO55226 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChadO55226 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChadO55226 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChadO55226 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ChadO55226 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChadO55226 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChadO55226 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChadO55226 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChadO55226 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChadO55226 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChadO55226 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChadO55226 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChadO55226 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChadO55226 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChadO55226 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChadO55226 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChadO55226 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChadO55226 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ChadO55226 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChadO55226 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChadO55226 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChadO55226 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChadO55226 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChadO55226 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChadO55226 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChadO55226 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChadO55226 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChadO55226 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChadO55226 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChadO55226 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChadO55226 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChadO55226 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChadO55226 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChadO55226 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChadO55226 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChadO55226 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ChadO55226 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChadO55226 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms