Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms