Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BckdkO55028 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BckdkO55028 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BckdkO55028 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
BckdkO55028 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BckdkO55028 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BckdkO55028 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BckdkO55028 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BckdkO55028 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms