Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnk2O54967 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnk2O54967 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnk2O54967 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnk2O54967 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnk2O54967 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnk2O54967 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnk2O54967 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tnk2O54967 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms