Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pole2O54956 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pole2O54956 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pole2O54956 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole2O54956 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole2O54956 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms