Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NlkO54949 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NlkO54949 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NlkO54949 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NlkO54949 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NlkO54949 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NlkO54949 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NlkO54949 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NlkO54949 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NlkO54949 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NlkO54949 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NlkO54949 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NlkO54949 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NlkO54949 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NlkO54949 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NlkO54949 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NlkO54949 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NlkO54949 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NlkO54949 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NlkO54949 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NlkO54949 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NlkO54949 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NlkO54949 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NlkO54949 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NlkO54949 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NlkO54949 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NlkO54949 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NlkO54949 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NlkO54949 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NlkO54949 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NlkO54949 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NlkO54949 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NlkO54949 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
NlkO54949 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NlkO54949 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NlkO54949 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NlkO54949 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NlkO54949 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NlkO54949 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NlkO54949 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NlkO54949 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NlkO54949 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NlkO54949 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NlkO54949 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NlkO54949 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NlkO54949 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NlkO54949 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NlkO54949 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NlkO54949 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NlkO54949 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NlkO54949 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NlkO54949 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NlkO54949 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NlkO54949 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NlkO54949 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NlkO54949 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NlkO54949 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NlkO54949 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NlkO54949 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NlkO54949 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NlkO54949 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NlkO54949 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NlkO54949 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NlkO54949 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NlkO54949 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NlkO54949 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NlkO54949 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NlkO54949 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NlkO54949 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NlkO54949 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NlkO54949 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NlkO54949 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NlkO54949 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NlkO54949 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NlkO54949 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NlkO54949 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NlkO54949 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NlkO54949 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NlkO54949 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NlkO54949 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NlkO54949 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NlkO54949 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NlkO54949 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NlkO54949 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NlkO54949 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NlkO54949 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NlkO54949 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NlkO54949 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NlkO54949 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NlkO54949 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NlkO54949 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NlkO54949 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NlkO54949 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NlkO54949 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NlkO54949 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NlkO54949 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NlkO54949 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NlkO54949 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NlkO54949 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NlkO54949 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms