Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Csnk2a2O54833 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms