Protein–RNA interactions for Protein: O35900

Lsm2, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm2O35900 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lsm2O35900 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm2O35900 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms