Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Abcc1O35379 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Abcc1O35379 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms