Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kpna6O35345 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms