Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms