Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d1bO35324 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms