Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Ebi3O35228 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ebi3O35228 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ebi3O35228 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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