Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcns1O35173 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcns1O35173 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcns1O35173 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcns1O35173 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcns1O35173 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcns1O35173 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcns1O35173 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcns1O35173 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcns1O35173 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcns1O35173 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcns1O35173 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcns1O35173 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcns1O35173 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcns1O35173 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcns1O35173 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcns1O35173 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcns1O35173 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcns1O35173 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcns1O35173 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcns1O35173 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcns1O35173 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcns1O35173 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcns1O35173 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcns1O35173 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcns1O35173 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcns1O35173 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcns1O35173 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcns1O35173 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcns1O35173 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcns1O35173 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcns1O35173 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcns1O35173 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcns1O35173 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcns1O35173 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms