Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Scarb2O35114 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Scarb2O35114 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Scarb2O35114 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Scarb2O35114 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Scarb2O35114 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Scarb2O35114 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Scarb2O35114 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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