Protein–RNA interactions for Protein: O09000

Ncoa3, Nuclear receptor coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa3O09000 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ncoa3O09000 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ncoa3O09000 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ncoa3O09000 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ncoa3O09000 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ncoa3O09000 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ncoa3O09000 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ncoa3O09000 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ncoa3O09000 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ncoa3O09000 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ncoa3O09000 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ncoa3O09000 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ncoa3O09000 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ncoa3O09000 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ncoa3O09000 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ncoa3O09000 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ncoa3O09000 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ncoa3O09000 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ncoa3O09000 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ncoa3O09000 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ncoa3O09000 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ncoa3O09000 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ncoa3O09000 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ncoa3O09000 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ncoa3O09000 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ncoa3O09000 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ncoa3O09000 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ncoa3O09000 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ncoa3O09000 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ncoa3O09000 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ncoa3O09000 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ncoa3O09000 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ncoa3O09000 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ncoa3O09000 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ncoa3O09000 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ncoa3O09000 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms