Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dctn1O08788 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dctn1O08788 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dctn1O08788 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dctn1O08788 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dctn1O08788 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dctn1O08788 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dctn1O08788 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dctn1O08788 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dctn1O08788 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dctn1O08788 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dctn1O08788 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Dctn1O08788 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dctn1O08788 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dctn1O08788 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dctn1O08788 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dctn1O08788 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dctn1O08788 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dctn1O08788 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dctn1O08788 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dctn1O08788 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dctn1O08788 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dctn1O08788 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dctn1O08788 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dctn1O08788 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dctn1O08788 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dctn1O08788 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dctn1O08788 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dctn1O08788 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dctn1O08788 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dctn1O08788 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dctn1O08788 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dctn1O08788 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dctn1O08788 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dctn1O08788 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dctn1O08788 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dctn1O08788 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dctn1O08788 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dctn1O08788 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dctn1O08788 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dctn1O08788 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms