Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CltaO08585 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CltaO08585 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CltaO08585 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CltaO08585 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CltaO08585 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CltaO08585 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CltaO08585 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CltaO08585 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CltaO08585 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CltaO08585 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CltaO08585 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CltaO08585 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CltaO08585 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CltaO08585 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CltaO08585 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CltaO08585 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CltaO08585 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CltaO08585 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CltaO08585 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CltaO08585 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CltaO08585 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CltaO08585 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CltaO08585 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CltaO08585 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CltaO08585 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CltaO08585 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CltaO08585 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CltaO08585 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CltaO08585 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CltaO08585 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CltaO08585 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CltaO08585 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CltaO08585 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CltaO08585 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CltaO08585 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CltaO08585 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CltaO08585 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CltaO08585 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CltaO08585 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CltaO08585 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CltaO08585 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CltaO08585 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CltaO08585 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CltaO08585 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CltaO08585 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CltaO08585 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CltaO08585 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CltaO08585 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CltaO08585 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CltaO08585 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CltaO08585 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CltaO08585 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CltaO08585 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CltaO08585 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CltaO08585 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CltaO08585 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CltaO08585 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CltaO08585 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CltaO08585 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CltaO08585 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CltaO08585 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CltaO08585 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CltaO08585 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CltaO08585 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CltaO08585 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CltaO08585 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CltaO08585 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CltaO08585 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CltaO08585 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CltaO08585 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CltaO08585 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CltaO08585 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CltaO08585 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CltaO08585 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CltaO08585 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CltaO08585 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CltaO08585 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CltaO08585 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CltaO08585 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CltaO08585 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CltaO08585 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CltaO08585 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CltaO08585 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CltaO08585 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CltaO08585 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CltaO08585 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CltaO08585 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CltaO08585 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CltaO08585 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CltaO08585 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CltaO08585 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CltaO08585 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CltaO08585 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CltaO08585 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CltaO08585 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CltaO08585 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CltaO08585 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CltaO08585 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CltaO08585 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms