Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E3

Gm8050, Predicted gene 8050, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8050L7N2E3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8050L7N2E3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms