Protein–RNA interactions for Protein: L7N291

Gm8857, Predicted gene 8857 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8857L7N291 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm8857L7N291 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm8857L7N291 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm8857L7N291 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm8857L7N291 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm8857L7N291 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm8857L7N291 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm8857L7N291 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm8857L7N291 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm8857L7N291 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm8857L7N291 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm8857L7N291 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm8857L7N291 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm8857L7N291 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm8857L7N291 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm8857L7N291 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms