Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6871L7N248 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6871L7N248 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6871L7N248 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6871L7N248 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6871L7N248 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6871L7N248 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6871L7N248 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6871L7N248 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6871L7N248 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6871L7N248 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6871L7N248 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6871L7N248 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6871L7N248 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm6871L7N248 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm6871L7N248 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6871L7N248 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms