Protein–RNA interactions for Protein: L7N232

Zfp955b, Zinc finger protein 955B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp955bL7N232 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp955bL7N232 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp955bL7N232 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp955bL7N232 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp955bL7N232 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp955bL7N232 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp955bL7N232 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp955bL7N232 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp955bL7N232 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp955bL7N232 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp955bL7N232 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp955bL7N232 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp955bL7N232 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp955bL7N232 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp955bL7N232 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp955bL7N232 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp955bL7N232 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp955bL7N232 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp955bL7N232 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp955bL7N232 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp955bL7N232 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp955bL7N232 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp955bL7N232 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp955bL7N232 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms