Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Wfdc16-201ENSMUST00000109336 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm42464-201ENSMUST00000196717 417 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Olfr779-202ENSMUST00000222301 929 ntAPPRIS P5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm44080-201ENSMUST00000204451 2214 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm12269-201ENSMUST00000122273 717 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms