Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms