Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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