Protein–RNA interactions for Protein: J3QNX5

Shisa8, Cysteine-knot AMPAR-modulating protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa8J3QNX5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Shisa8J3QNX5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms