Protein–RNA interactions for Protein: J3QNW5

Gm21797, Predicted gene, 21797, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21797J3QNW5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21797J3QNW5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21797J3QNW5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21797J3QNW5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21797J3QNW5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21797J3QNW5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21797J3QNW5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21797J3QNW5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21797J3QNW5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21797J3QNW5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21797J3QNW5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21797J3QNW5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21797J3QNW5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21797J3QNW5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21797J3QNW5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21797J3QNW5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21797J3QNW5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21797J3QNW5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21797J3QNW5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21797J3QNW5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21797J3QNW5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21797J3QNW5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21797J3QNW5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21797J3QNW5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21797J3QNW5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21797J3QNW5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21797J3QNW5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21797J3QNW5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21797J3QNW5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21797J3QNW5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21797J3QNW5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21797J3QNW5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21797J3QNW5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm21797J3QNW5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm21797J3QNW5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm21797J3QNW5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21797J3QNW5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21797J3QNW5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21797J3QNW5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21797J3QNW5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21797J3QNW5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms