Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Gm17577J3QNF7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Gm17577J3QNF7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Gm17577J3QNF7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Gm17577J3QNF7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Gm17577J3QNF7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Gm17577J3QNF7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Gm17577J3QNF7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Gm17577J3QNF7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Gm17577J3QNF7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Gm17577J3QNF7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Gm17577J3QNF7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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