Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gm21972J3QN38 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms