Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gm20873J3QMQ9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20873J3QMQ9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20873J3QMQ9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20873J3QMQ9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20873J3QMQ9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20873J3QMQ9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20873J3QMQ9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20873J3QMQ9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20873J3QMQ9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20873J3QMQ9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20873J3QMQ9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20873J3QMQ9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20873J3QMQ9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20873J3QMQ9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20873J3QMQ9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20873J3QMQ9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20873J3QMQ9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20873J3QMQ9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gm20873J3QMQ9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gm20873J3QMQ9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gm20873J3QMQ9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20873J3QMQ9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gm20873J3QMQ9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20873J3QMQ9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20873J3QMQ9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20873J3QMQ9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20873J3QMQ9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Gm20873J3QMQ9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Gm20873J3QMQ9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20873J3QMQ9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Gm20873J3QMQ9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20873J3QMQ9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20873J3QMQ9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20873J3QMQ9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20873J3QMQ9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20873J3QMQ9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20873J3QMQ9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20873J3QMQ9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20873J3QMQ9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20873J3QMQ9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20873J3QMQ9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20873J3QMQ9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20873J3QMQ9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20873J3QMQ9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20873J3QMQ9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20873J3QMQ9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20873J3QMQ9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20873J3QMQ9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20873J3QMQ9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20873J3QMQ9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20873J3QMQ9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20873J3QMQ9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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