Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem200cJ3QK46 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem200cJ3QK46 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem200cJ3QK46 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem200cJ3QK46 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem200cJ3QK46 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem200cJ3QK46 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem200cJ3QK46 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem200cJ3QK46 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem200cJ3QK46 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem200cJ3QK46 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem200cJ3QK46 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem200cJ3QK46 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem200cJ3QK46 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem200cJ3QK46 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem200cJ3QK46 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem200cJ3QK46 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem200cJ3QK46 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem200cJ3QK46 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem200cJ3QK46 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem200cJ3QK46 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem200cJ3QK46 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem200cJ3QK46 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem200cJ3QK46 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem200cJ3QK46 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem200cJ3QK46 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem200cJ3QK46 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem200cJ3QK46 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem200cJ3QK46 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem200cJ3QK46 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem200cJ3QK46 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tmem200cJ3QK46 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tmem200cJ3QK46 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tmem200cJ3QK46 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tmem200cJ3QK46 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem200cJ3QK46 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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