Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm21060J3KMU4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21060J3KMU4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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