Protein–RNA interactions for Protein: J3KML9

Gm21913, Predicted gene, 21913, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21913J3KML9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21913J3KML9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21913J3KML9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21913J3KML9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21913J3KML9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21913J3KML9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21913J3KML9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21913J3KML9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gm21913J3KML9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21913J3KML9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21913J3KML9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21913J3KML9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gm21913J3KML9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21913J3KML9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21913J3KML9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21913J3KML9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21913J3KML9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm21913J3KML9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm21913J3KML9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm21913J3KML9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm21913J3KML9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21913J3KML9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21913J3KML9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21913J3KML9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm21913J3KML9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm21913J3KML9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21913J3KML9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm21913J3KML9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21913J3KML9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21913J3KML9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21913J3KML9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21913J3KML9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21913J3KML9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21913J3KML9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21913J3KML9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm21913J3KML9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm21913J3KML9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm21913J3KML9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21913J3KML9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21913J3KML9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Gm21913J3KML9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21913J3KML9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21913J3KML9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21913J3KML9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21913J3KML9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21913J3KML9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21913J3KML9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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