Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm29394H3BIW7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms