Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pabpc4lG5E8X2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms