Protein–RNA interactions for Protein: G5E8H9

Rdh19, MCG134493, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh19G5E8H9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh19G5E8H9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms