Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G2

Usp17ld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein D, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17ldG5E8G2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17ldG5E8G2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17ldG5E8G2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17ldG5E8G2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17ldG5E8G2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp17ldG5E8G2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp17ldG5E8G2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp17ldG5E8G2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp17ldG5E8G2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp17ldG5E8G2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp17ldG5E8G2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp17ldG5E8G2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp17ldG5E8G2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp17ldG5E8G2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp17ldG5E8G2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp17ldG5E8G2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp17ldG5E8G2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp17ldG5E8G2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp17ldG5E8G2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp17ldG5E8G2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp17ldG5E8G2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp17ldG5E8G2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp17ldG5E8G2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp17ldG5E8G2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp17ldG5E8G2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms