Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r12G5E8G1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms