Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r167G3UW71 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r167G3UW71 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms