Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp9yF8VPU6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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